Facultatea de Teologie Ortodoxa din Constanta a pornit prin infiintarea Catedrei de Teologie in cadrul Facultatii de Litere a Universitatii Ovidius (1992-1993).
Incepand cu anul 2004, Facultatea de Teologie Ortodoxa si-a capatat autonomia, separandu-se de Facultatea de Litere.
In prezent, Facultatea de Teologie Ortodoxa are 3 specializari: pastroala, didactica si asistenta sociala.
Din anul 2004, Facultatea de Teologie Ortodoxa din Constanta are in componenta sa si Scoala Doctorala in cadrul careia exista 9 cadre didactice indrumatoare de doctorat.